इमरान हाशमी ने 14 दिसंबर 2006 को परवीन शाहानी से शादी की थी, जो लाइमलाइट से दूर रहती हैं और इमरान उन्हें अपने जीवन की सबसे बड़ी ताकत मानते हैं।
इमरान के बेटे अयान को 2014 में 3 साल की उम्र में किडनी ट्यूमर (फर्स्ट-स्टेज कैंसर) हुआ था, जिसे उन्होंने मात दी और इमरान ने इस संघर्ष पर 'द किस ऑफ लाइफ' किताब लिखी।
इमरान हाशमी का फिल्मी परिवार से गहरा नाता है; महेश भट्ट और मुकेश भट्ट उनके मामा हैं, जबकि आलिया भट्ट और मोहित सूरी उनके कजिन्स हैं।